Сравнение остатков на складах в 1С: перемещение недостающих товаров

Настоятельно рекомендую решение http://subsystems.ru/catalog/program=150/

Там как раз то что вам нужно!
И не только сравнение остатков, также выдача продаж, точек заказа.

Весь отчет работает с номенклатурой и характеристиками.

А отборы помогают ставить условия. Например чтобы отчет не получился огромным можно поставить отборы по первому и второму складу.

Например вывести товары которые есть на главном складе, но например нет в нужном количестве (ставим условие меньше 5) на розничном.
И так далее. С отборами там очень многое возможно. Ни в одном стандартном отчете или написанном под заказ вы не найдете таких возможностей.

В итоге создается перечень остатков к перемещению. Обработка создает документы Перемещение товаров на складах либо Внутренняя заявка на перемещение.
Увеличите скорость обработки и создания в сотню раз.