Бардак в базе 1С - кривые партии, ошибки в заказах покупателей и заказах поставщикам

Теперь более к конкретике. Во первых нужен специалист, если у вас таких нет, то в любом случае вы ничего не сможете сделать самостоятельно.
Ручную правку никто не отменял, но по факту если смотреть правде в глаза - шансы близятся к нулю.
Ошибки могут и должны исправлять в момент реального виденья мелкой ошибки, а не когда их уже вагон и тележка.

Рекомендую запустить специально написанную обработку для 1С по выявлению всех ошибок https://subsystems.ru/solutions/program=120/
Рекомендую запустить обработку которая исправляет легкие ошибки https://subsystems.ru/solutions/program=121/
В остальных случаях нужно предметно смотреть на конкретной базе, что было убито и как. И вырабатывать логические действия, которые могут исправить ситуацию.

Ошибка правки приходных накладных в день когда была реализация.

Достаточно простая. Если было определено что документ менял время и становился после реализации, то сдесь поможет обработка которая поставит все приходные накладные в начало дня (и далее будет перепроводка, которая спишет партии и себестоимость)

Ошибки в заказах покупателей и заказах поставщикам

Тут я не рекомендую даже заморачиваться тем что где то что то исправить (преставить товары или еще чего). Заказы в 1С имеют одну задачу - они живут до той поры пока в них есть потребность, они актуальны и влияют на текущие продажи и закупки. Как только заказ выполнен, поверьте вы никогда не будете больше смотреть какие то супер ведомости по заказам.
У вас уже в базе есть фактические продажи клиентам, и закупки.
В случае если ошибки зашкаливают и в отчеты сыпятся старые заказы, которые уже давно выполнены - то самое правильно что будет сделать в базе 1С - это свернуть их вообще полностью.
Но сделать это не обрезкой базы а очисткой не нужной инфо (мы даже немного сократим размер базы и соответствующих регистров). Ну если прямо нужно будет критично - всегда будет копия базы.

Как правильно сделать свертку старых заказов.

ШАГ 1 - Снять все заказы покупателей и поставщикам с проведения полностью до указанной даты
ШАГ 2 - Снять корректировки заказов, если таковые выполнялись, и проверить еще несколько видов документов - которые могли бы связаны быть с ними (резервирование, перемещения)
ШАГ 3 - Сделать запрос по всем реализациям в базе в которых в основании указаны заказы до указанной даты, и очистить это поле в реализациях.
ШАГ 4 - Сделать запрос по всем поступлениям в базе, в основании которых есть заказы поставщикам, и очистить эти поля.
ШАГ 5 - Перепровести базу.
Естественнно перепроводка базы только по этой части будет невозможна если еще будут ошибки по другим участкам учета, которые будут выдавать ошибки и останавливать проведение. Поэтому тут нужно комплексно подходить и готовить весь пакет исправления багов.

Все указанные действия - не только очистят в базе все косяки и проблемы, но и сократят объем базы(пусть даже не намного, но все равно).
Можно было бы это сделать вообще вплоть до текущей даты. Чтобы убрать ошибки и по текущим заказам. А менеджеры скопируют или проведут только реальные активные заказы покупателей и заказы поставщикам.